به گزارش همشهری آنلاین، تا قبل از آن کلیسای مریم مقدس در خیابان میرزا کوچک خان مرکز خلیفه گری و کلیسای جامع ارمنی‌ها بود. سرکیسیان زمینی در نبش خیابان ویلا خرید، اما قبل از ساخت کلیسا از دنیا رفت. بعد از مرگ مارکام سرکیسیان، پسرانش گورکن و وازگن سرکیسیان هزینه‌های ساخت کلیسا را پرداخت کردند و مهندس اوژن آفتاندلیانس، کلیسا را با سبک معماری قرون وسطی و معماری عصر جدید ارمنستان طراحی کرد.
ساخت‌وساز کلیسا سال۱۳۴۹ توسط لئون کشیشیان آغاز و ۳سال بعد یعنی ۹اردیبهشت۱۳۵۲ با هزینه‌ای نزدیک به سه و نیم میلیون تومان با نام سرکیس مقدس افتتاح شد. در مراسم افتتاح کلیسا بیش از ۵هزار نفر از ارامنه تهران حضور داشتند و همان زمان مقر خلیفه‌گری ارامنه تهران از کلیسای مریم مقدس به این محل جدید انتقال پیدا کرد. این کلیسا که بر پایه نقشه بازیلیکا (کلیساهای مهم و بزرگ که به شکل صلیب است) ساخته شده در سال‌های دفاع مقدس با اصابت موشک، بخشی از آن آسیب دید و سال‌های بعد مرمت شد.
سرکیس مقدس از سرداران روم در سده چهارم میلادی بود و به‌خاطر مسیحی بودن، تحت تعقیب و همراه پسرش به ارمنستان فرار کرد، اما تیران، پادشاه ارمنستان هم تحت فشار امپراتور روم، آنها را اخراج کرد. بعد از آن سرکیس مقدس و پسرش به ایران فرار کردند و به خدمت ارتش شاپور دوم درآمدند، اما این مسیحی در ایران هم سرنوشت خوبی نداشت و در نهایت به اتهام تبلیغ مسیحیت بین سربازان به مرگ محکوم شد.
